中央集权程度越深，医药就越需要集中统一管理，而有明一代，恰恰是历朝历代皇权的顶峰。
太医院之下，还有诸多的宫廷、地方医药机构。
如御药房、生药库、安乐堂、典药局及地方上的惠民药局、王府良医所、州府医学教育机构等，都受太医院直接或间接的管理。
全国各地按年派纳的药材，需要送往生药库中统计品种、数量，进行存放，最后在需要用药的时候，由御药房负责分派药品。
其余安乐堂，典药局等宫廷医药机构，也都归属于太医院，各自有其职能。
安乐堂专事安置无权势、重病垂危的太监，典药局责位于东宫，是东宫六局之一，负责东宫的治病用药，不册封太子时不设。
册封太子后，由太医院派遣一名御医作为局丞管理典药局，另拨给诸多小吏，作为辅助。
其余东宫五局，也都是册封太子后才会重新设立。
诸如王府良医所，负责各王府的治病用药，惠民药局相当于朝廷免费给百姓发放治疗药品和看病治病的官办医院。
这些诸多宫廷或地方的医疗机构，都统一由紫禁城内的太医院官署管理。
太医院眼下如此的萎靡不振，全国各地的医疗机构，只怕是尽皆如此。
这可能也是眼下各地百姓体弱多病，对朝廷不满的另外一个原因。
全国上下，与医药有关的事宜，都需要经过太医院的协调处置才能得以实行。
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