在自然群体中往往有一种占多数的等位基因，称为野生型基因。
同一座位上的其他等位基因一般都直接或间接地由野生型基因通过突变产生，相对于野生型基因，称它们为突变型基因。在二倍体的细胞或个体内有两个同源染色体，所以每一个座位上有两个等位基因。
如果这两个等位基因是相同的，那么就这个基因座位来讲，这种细胞或个体称为纯合体。
如果这两个等位基因是不同的，就称为杂合体。
在杂合体中，两个不同的等位基因往往只表现一个基因的性状，这个基因称为显性基因，另一个基因则称为隐性基因。
在二倍体的生物群体中等位基因往往不止两个，两个以上的等位基因称为复等位基因。
不过有一部分早期认为是属于复等位基因的基因，实际上并不是真正的等位，而是在功能上密切相关、在位置上又邻接的几个基因，所以把它们另称为拟等位基因。
“难道是利用的拟等位基因？”李瑜自言自语。
实际上，某些表型效应差异极少的复等位基因的存在很容易被忽视，通过特殊的遗传学分析可以分辨出存在于野生群体中的几个等位基因。
这种从性状上难以区分的复等位基因称为同等位基因。许多编码同工酶的基因也是同等位基因。
对于基因的奥秘，李瑜始终觉得，自己苦想无用，或许能从蚂蚁女王的身上找到答案。
而蚂蚁女王也确实给了他答案，让他用精神力去改写基因的程序。
一旦成功，李瑜就将无所不能，甚至成为神话中的完美生物。
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